Bij LEGO Ninjago staan 6 jonge Ninja's centraal; Kai, Cole, Jay, Lloyd, Zane en Nya.
Ze zijn opgeleid door hun meester Sensei Wu om te strijden tegen de kwade krachten
en het land van Ninjago te beschermen. De kwade krachten zijn o.a. de Skullkin,
Serpentine, Stone Leger, Nindroids, Anacondrai Cultists en Sky Pirates.